Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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