Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctdnep1Q3TP92 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms