Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cwc27Q3TKY6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cwc27Q3TKY6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms