Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca4Q3TKT4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms