Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp39Q3TIX9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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