Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms