Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gbp8Q2V6D6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gbp8Q2V6D6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms