Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms