Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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