Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cib3Q0P523 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms