Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms