Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms