Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms