Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms