Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atf4Q06507 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms