Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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