Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms