Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nf1Q04690 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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