Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms