Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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