Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1sQ02789 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms