Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Col6a2Q02788 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col6a2Q02788 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col6a2Q02788 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col6a2Q02788 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col6a2Q02788 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col6a2Q02788 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms