Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GscQ02591 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GscQ02591 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GscQ02591 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms