Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms