Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms