Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcqQ02111 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms