Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RykQ01887 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RykQ01887 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RykQ01887 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms