Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms