Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms