Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms