Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms