Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms