Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms