Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlkP97793 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlkP97793 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlkP97793 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms