Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited1P97769 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited1P97769 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms