Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp1P97350 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms