Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mesp1P97309 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mesp1P97309 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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