Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx3P81067 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx3P81067 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms