Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8a1P70704 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8a1P70704 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms