Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms