Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad50P70388 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad50P70388 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad50P70388 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad50P70388 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad50P70388 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad50P70388 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad50P70388 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad50P70388 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad50P70388 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad50P70388 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms