Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms