Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms