Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UbdP63072 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UbdP63072 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UbdP63072 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UbdP63072 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UbdP63072 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms