Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms