Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd1P62315 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd1P62315 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms