Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms