Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ufm1P61961 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ufm1P61961 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ufm1P61961 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ufm1P61961 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ufm1P61961 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ufm1P61961 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ufm1P61961 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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