Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Vbp1P61759 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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