Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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